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序號劃定機關保護區名稱流域別劃定面積(公頃)公告日期公告文號空間查詢
1環保署白河水庫急水溪2,683.07880901(88)環署中字第0006564號
2環保署曾文水庫曾文溪38,907.30881124(88)環署中字第0014019號
3環保署高屏溪高屏溪175,450.00890401(89)環署中字第0007318號
4環保署石門水庫大漢溪(淡水河系)55,923.80890429(89)環署中字第0008601號
5臺北市鹿角坑清水溪(磺溪)273.30871203府環二字第8708049201號
6臺灣省蘭潭仁義潭八掌溪657.97870723八七府環五字第153378號
7臺灣省南化水庫曾文溪10,904.76870730八七府環五字第153393號
8基隆市新山水庫淡水河(基隆河)139.86880730(88)基府環字第072835號
9基隆市西勢水庫淡水河(基隆河)675.90880730(88)基府環字第072835號
10新北市老梅溪老梅溪994.911000222北府環水字第1000021675號
11新北市瑪鋉溪瑪鋉溪1,756.501000222北府環水字第1000021760號
12新北市百拉卡山澗水(公司田溪)132.091000222北府環水字第1000021666號
13新北市叭嗹溪叭嗹溪43.721000222北府環水字第1000021543號
14新北市雙溪貢寮雙溪1,947.301000223北府環水字第1000021658號
15新竹縣寶山水庫頭前溪57.80870819八七府環二字第89700號
16苗栗縣永和山水庫中港溪471.9699120299府環水字第0997803130號
17苗栗縣田美水庫中港溪14,586.5899120299府環水字第0997803130號
18苗栗縣明德水庫後龍溪6,092.5299120299府環水字第0997803130號
19苗栗縣鯉魚潭水庫大安溪5,931.0999120299府環水字第0997803130號
20臺中市稍來溪大甲溪1,837.911010621中市環衛字第1010053098號
21臺中市七家灣溪大甲溪7,415.471010621中市環衛字第1010053098號
22臺中市四季郎溪大甲溪4,112.691010621中市環衛字第1010053098號
23臺中市志樂溪大甲溪8,723.581010621中市環衛字第1010053098號
24臺中市匹亞桑溪大甲溪3,637.981010621中市環衛字第1010053098號
25臺中市小雪溪大甲溪2,210.151010621中市環衛字第1010053098號
26南投縣霧社第一烏溪12.17871009八七投府環二字第144056號
27南投縣霧社第二烏溪28.39871009八七投府環二字第144056號
28南投縣霧社第三烏溪21.78871009八七投府環二字第144056號
29南投縣信義濁水溪364.60871009八七投府環二字第144056號
30南投縣羅娜濁水溪1,435.32871009八七投府環二字第144056號
31南投縣公林烏溪132.61871009八七投府環二字第144056號
32南投縣東光烏溪824.06871009八七投府環二字第144056號
33南投縣合歡溪木蘭橋大甲溪4,141.38871009八七投府環二字第144056號
34嘉義縣梅山大半天寮北港溪122.42871006八七府環字第119376號
35嘉義縣水波林北港溪255.28871113八七府環字第137091號
36嘉義縣八掌溪八掌溪9,038.91880706八八府環字第081062號
37臺南市烏山頭水庫曾文溪5,840.041001012府環水字第1000780065號
38臺南市鏡面水庫曾文溪262.241001012府環水字第1000780066號
39高雄市澄清湖水庫(高屏溪流域)358.001000804高市府四維環土字第1000074600號
40屏東縣牡丹水庫四重溪4,243.35901105(90)屏府環水字第180210號
41宜蘭縣松羅蘭陽溪1,397.65870713八七府環二字第09826號
42宜蘭縣英士蘭陽溪16.64870623八七府環二字第008838號
43宜蘭縣四季蘭陽溪49.09870713八七府環二字第09826號
44宜蘭縣南山蘭陽溪270.53870713八七府環二字第09826號
45花蓮縣砂婆礑美崙溪1,715.01880922八八府環二字第77881號
46花蓮縣西林花蓮溪131.71880922八八府環二字第77881號
47花蓮縣鳳林花蓮溪528.59880922八八府環二字第77881號
48花蓮縣北林花蓮溪575.04880922八八府環二字第77881號
49花蓮縣富源秀姑巒溪392.32880922八八府環二字第77881號
50花蓮縣新社大不岸溪76.99880922八八府環二字第77881號
51臺東縣初鹿太平溪70.75871130八七府環二字第9348號
52臺東縣班鳩太平溪237.82871130八七府環二字第9348號
53臺東縣建和知本溪102.13871130八七府環二字第9348號
54臺東縣泰安太平溪1,161.42871130八七府環二字第9348號
55臺東縣知本知本溪192.89871130八七府環二字第9348號
56臺東縣利嘉太平溪156.32871130八七府環二字第9348號
57臺東縣鹿野第一、第二卑南溪291.99871130八七府環二字第9348號
58臺東縣關山卑南溪290.12871130八七府環二字第9348號
59臺東縣利稻卑南溪10.07871130八七府環二字第9348號
60臺東縣海端卑南溪170.71871130八七府環二字第9348號
61臺東縣都蘭 308.15871130八七府環二字第9348號
62臺東縣成功 2,567.70871130八七府環二字第9348號
63臺東縣長濱 238.33871130八七府環二字第9348號
64臺東縣壢坵金崙溪524.93871130八七府環二字第9348號
65臺東縣金崙金崙溪586.69871130八七府環二字第9348號
66臺東縣台板大竹溪178.05871130八七府環二字第9348號
67臺東縣土板大竹溪347.88871130八七府環二字第9348號
68臺東縣新化大武溪7.89871130八七府環二字第9348號
69臺東縣綠島流麻溝流麻溝溪147.60890208八九府環二字第973號
70澎湖縣成功水庫 418.72870831八七彭府環二字第53531號
71澎湖縣東衛水庫 149.95870831八七彭府環二字第53531號
72澎湖縣興仁水庫 267.25870831八七彭府環二字第53531號
73澎湖縣小池水庫 6.94900504(九十)澎府環管字第19159號
74澎湖縣西安水庫 10.84900504(九十)澎府環管字第19159號
75澎湖縣七美水庫 8.25900504(九十)澎府環管字第19159號
76金門縣太湖 39.03890504八九府環字第8919470號
77金門縣榮湖 13.50890504八九府環字第8919470號
78金門縣田浦水庫 17.80890504八九府環字第8919470號
79金門縣擎天水庫 8.70890504八九府環字第8919470號
80金門縣西湖 2.80890504八九府環字第8919470號
81金門縣菱湖 2.76890504八九府環字第8919470號
82金門縣蓮湖 0.65890504八九府環字第8919470號
83金門縣陽明水庫 4.12890504八九府環字第8919470號
84金門縣瓊林水庫 10.40890504八九府環字第8919470號
85金門縣金沙水庫 25.50890504八九府環字第8919470號
86金門縣山西水庫 12.53890504八九府環字第8919470號